Lista de Episodios del anime Charlotte, dio inicio en Japón el 5 de julio y concluyó el 27 de septiembre de 2015, con un total de 13 episodios. Un OVA salió el 30 de marzo de 2016.
Habilidades especiales a desarrollar en una pequeña parte de los adolescentes. Haciendo pleno uso de la capacidad especial para asumir cualquier cuerpo por sólo cinco segundos, Yū Otosaka fue haciendo pleno uso de sus capacidades, incluso para pasar un examen a una escuela prestigiosa magníficamente. Sin embargo justo cuando la vida en la Academia Hoshinōmi era lisa vela, una chica llamada Nao Tomori apareció ante ojos de Yū.
Yū comienza su vida como miembro del Consejo de estudiantes de la Academia Hoshinōmi, cuyo trabajo es asegurar la seguridad de los estudiantes con poderes sobrenaturales. Su primer trabajo les lleva a la Academia Nanba, donde cogen a un estudiante llamado Udō usando su habilidad para producir fotografías mentales de las chicas en ropa interior, vendiéndolas para un beneficio. Al día siguiente, Nao toma a Yū para ver a su gran hermano, que había sido experimentado por su habilidad para manipular las ondas sonoras, dejándolo destruido emocionalmente. Nao más explica que gracias a una persona que confía en ella, ella fue capaz de escapar de la escuela que experimentó en su hermano y llevarlo a un ambiente.
Nao, Yū y Jōjirō investigan a una persona la cual sorpresivamente cuenta con 2 habilidades sobrehumanas, para sorpresa de todos y más para Jōjirō es Yusa Nishimori, la idol y vocalista de la banda How-Low-Hello.
Luego de que Yusa Nishimori se transfiriera a la Academia Hoshinōmi, Nao Tomori la hace miembro del Consejo Estudiantil, por lo que su primera misión como nueva integrante es buscar junto a los demás a un usuario con la habilidad de Telequinesis llamado Arifumi Fukuyama.
Los cuatro miembros del Consejo Estudiantil planean enfrentarse a un usuario con la capacidad de volar. Nao decide que el Consejo Estudiantil de campamento en las montañas donde ha estado entrenando al usuario para controlar su habilidad. Durante las dos primeras noches, Yusa le dice a los otros miembros acerca de su relación con la Misa, mientras que Yū interactúa con Nao y Jōjirō. Al día siguiente, el usuario de la habilidad se enfrenta a los miembros del Consejo y trata de amenazarlos en salir, pero Nao despide su amenaza como un farol. El usuario de capacidad luego roba una cámara de vídeo de Nao e intenta escapar usando su poder. Sin embargo, Yū logra apoderarse de su cuerpo mientras está volando y luego utiliza la capacidad del usuario para romper su caída, así evitando que escaparan. Nao luego convence al usuario a dejar de usar su habilidad. Finalmente, Yū cabezas de hogar para comer cenar y avisos que Ayumi ha caído enfermo.
La ubicación del nuevo portador de capacidad según Kumagami fue el condominio donde actualmente se encuentra Ayumi con un resfriado. Ayumi le dice a Yū y a Tomori, quien vino a ver lo que estaba haciendo sobre la pesadilla que tenía. Tomori, pensando en que detalles del sueño pueden ser una sugerencia en averiguar la capacidad de Ayumi, le dice a Yū como extraer el contenido del sueño de Ayumi.
Yu, cabizbajo por el hecho de que perdió a su hermana pequeña Ayumi, cierra a sí mismo solamente dentro de su casa y corta toda comunicación con el mundo exterior. Negar a incluso los miembros del Consejo de estudiante preocupado que vinieron a comprobar sobre él, Yu lleva una vida disoluta sólo para encontrar que aparecen delante de él...
Yū, empezando a aceptar la muerte de Ayumi, asiste a la escuela por primera vez en mucho tiempo. Allí, él encuentra comodidad en la vida escolar que no ha cambiado desde antes. Entonces, él termina encima de tener que asistir a un concierto de ZHIEND en vivo solo con Tomori, pero en el camino a casa desde la escuela ese día, topa con una mujer extranjera busca llevar un bastón blanco.
Al asistir al concierto de ZHIEND, la música da fuerzas a Yū para recordar sus recuerdos borrados por Maedomari de un pasado donde Ayumi, él mismo y Shunsuke fueron experimentos de laboratorio.
Shunsuke tiene el poder de salto a través del tiempo, pero ha perdido su vista al utilizar esta habilidad varias veces y ya no es capaz de usar su poder. Por lo tanto, ahora Yu debe tomar el lugar de su hermano y salvar a Ayumi.
Shunsuke habla sobre un cometa llamado Charlotte que es la causa de los seres humanos desarrollen extrañas habilidades. Su plan es crear una vacuna. Cuando un grupo de terroristas extranjeros amenaza a familia de Furuki, secuestran Nao y a Kumagami para obligar a Yū a venir con ellos. Lamentablemente, la lucha de Yū condujo a la muerte de Kumagami al detener a los terroristas en el proceso.
Los amigos del Consejo Estudiantil y Ayumi van a visitar a Yū que es hospitalizado por sus lesiones. Durante su conversación con Tomori, Yū toma una gran decisión.
Debido a que Yū inicio un viaje alrededor del mundo para robarle sus poderes a las personas, este comienza a perder la memoria y se descompone mentalmente. Las tarjetas de ayuda que le entrego Nao Tomori es lo único que pudo mantener a su lado. Cuando Yū concluye con la misión, Shunsuke lo salva de ser capturado por un hombre. Después de despertar en el hospital, Nao se entera de que Yū había perdido recuerdos de ella y de su promesa. Aún así, le dice que son una pareja. Más tarde, ambos deciden crear nuevos recuerdos junto con sus amigos y familiares.
Nao Tomori y Yū Otosaka ayudan a Yori Sekiguchi, una joven niña con la habilidad de leer los pensamientos de las personas.